Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AK157302I3ITR1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms