Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf148G3X9R7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf148G3X9R7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf148G3X9R7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf148G3X9R7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf148G3X9R7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf148G3X9R7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf148G3X9R7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf148G3X9R7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf148G3X9R7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf148G3X9R7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf148G3X9R7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf148G3X9R7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf148G3X9R7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf148G3X9R7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf148G3X9R7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf148G3X9R7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf148G3X9R7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf148G3X9R7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf148G3X9R7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf148G3X9R7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf148G3X9R7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rnf148G3X9R7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms