Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3tc1G3X9F6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3tc1G3X9F6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms