Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zkscan2G3X952 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zkscan2G3X952 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zkscan2G3X952 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zkscan2G3X952 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zkscan2G3X952 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zkscan2G3X952 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zkscan2G3X952 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zkscan2G3X952 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zkscan2G3X952 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zkscan2G3X952 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zkscan2G3X952 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Zkscan2G3X952 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zkscan2G3X952 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zkscan2G3X952 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zkscan2G3X952 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zkscan2G3X952 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zkscan2G3X952 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zkscan2G3X952 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zkscan2G3X952 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zkscan2G3X952 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zkscan2G3X952 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms