Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn34aG3UW52 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34aG3UW52 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms