Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK0

Ttc37, Tetratricopeptide repeat domain 37, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc37F8VPK0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ttc37F8VPK0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ttc37F8VPK0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms