Protein–RNA interactions for Protein: F7D1B3

4933402N22Rik, RIKEN cDNA 4933402N22 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402N22RikF7D1B3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933402N22RikF7D1B3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933402N22RikF7D1B3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933402N22RikF7D1B3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933402N22RikF7D1B3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933402N22RikF7D1B3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933402N22RikF7D1B3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
4933402N22RikF7D1B3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933402N22RikF7D1B3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933402N22RikF7D1B3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933402N22RikF7D1B3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933402N22RikF7D1B3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933402N22RikF7D1B3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933402N22RikF7D1B3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933402N22RikF7D1B3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933402N22RikF7D1B3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933402N22RikF7D1B3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933402N22RikF7D1B3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933402N22RikF7D1B3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933402N22RikF7D1B3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933402N22RikF7D1B3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933402N22RikF7D1B3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4933402N22RikF7D1B3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms