Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
D430041D05RikF6ZGR6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
D430041D05RikF6ZGR6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
D430041D05RikF6ZGR6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms