Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmod3E9QA62 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms