Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp17lbE9Q9U0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp17lbE9Q9U0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp17lbE9Q9U0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp17lbE9Q9U0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp17lbE9Q9U0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp17lbE9Q9U0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp17lbE9Q9U0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp17lbE9Q9U0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp17lbE9Q9U0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp17lbE9Q9U0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp17lbE9Q9U0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp17lbE9Q9U0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp17lbE9Q9U0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp17lbE9Q9U0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp17lbE9Q9U0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp17lbE9Q9U0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp17lbE9Q9U0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp17lbE9Q9U0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp17lbE9Q9U0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp17lbE9Q9U0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp17lbE9Q9U0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp17lbE9Q9U0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp17lbE9Q9U0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp17lbE9Q9U0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp17lbE9Q9U0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp17lbE9Q9U0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp17lbE9Q9U0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp17lbE9Q9U0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp17lbE9Q9U0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp17lbE9Q9U0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp17lbE9Q9U0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp17lbE9Q9U0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp17lbE9Q9U0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp17lbE9Q9U0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp17lbE9Q9U0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
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