Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Urb2E9Q7L1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Urb2E9Q7L1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Urb2E9Q7L1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Urb2E9Q7L1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Urb2E9Q7L1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Urb2E9Q7L1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Urb2E9Q7L1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Urb2E9Q7L1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Urb2E9Q7L1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Urb2E9Q7L1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms