Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R7

Utrn, Utrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UtrnE9Q6R7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UtrnE9Q6R7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UtrnE9Q6R7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UtrnE9Q6R7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.4 ms