Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc85cE9Q6B2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc85cE9Q6B2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms