Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtproE9Q612 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtproE9Q612 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtproE9Q612 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtproE9Q612 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtproE9Q612 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtproE9Q612 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtproE9Q612 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PtproE9Q612 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtproE9Q612 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtproE9Q612 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtproE9Q612 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtproE9Q612 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtproE9Q612 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtproE9Q612 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PtproE9Q612 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtproE9Q612 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtproE9Q612 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtproE9Q612 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtproE9Q612 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PtproE9Q612 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtproE9Q612 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtproE9Q612 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtproE9Q612 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtproE9Q612 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PtproE9Q612 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtproE9Q612 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtproE9Q612 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtproE9Q612 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtproE9Q612 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtproE9Q612 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtproE9Q612 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PtproE9Q612 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtproE9Q612 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtproE9Q612 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtproE9Q612 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtproE9Q612 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtproE9Q612 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms