Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5G2

Pcdhb9, Protocadherin beta 9, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb9E9Q5G2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcdhb9E9Q5G2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms