Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DspE9Q557 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DspE9Q557 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DspE9Q557 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
DspE9Q557 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms