Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4U5

Vmn2r56, Vomeronasal 2, receptor 56, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r56E9Q4U5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r56E9Q4U5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r56E9Q4U5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r56E9Q4U5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r56E9Q4U5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r56E9Q4U5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r56E9Q4U5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r56E9Q4U5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r56E9Q4U5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r56E9Q4U5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r56E9Q4U5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r56E9Q4U5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r56E9Q4U5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r56E9Q4U5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r56E9Q4U5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r56E9Q4U5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r56E9Q4U5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r56E9Q4U5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r56E9Q4U5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r56E9Q4U5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r56E9Q4U5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn2r56E9Q4U5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn2r56E9Q4U5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r56E9Q4U5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms