Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4S1

Pde8b, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, mousemouse

Predictions only

Length 865 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde8bE9Q4S1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pde8bE9Q4S1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde8bE9Q4S1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde8bE9Q4S1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde8bE9Q4S1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde8bE9Q4S1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde8bE9Q4S1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde8bE9Q4S1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde8bE9Q4S1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde8bE9Q4S1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde8bE9Q4S1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde8bE9Q4S1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde8bE9Q4S1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde8bE9Q4S1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde8bE9Q4S1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde8bE9Q4S1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde8bE9Q4S1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde8bE9Q4S1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde8bE9Q4S1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde8bE9Q4S1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde8bE9Q4S1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde8bE9Q4S1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde8bE9Q4S1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde8bE9Q4S1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde8bE9Q4S1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde8bE9Q4S1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde8bE9Q4S1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde8bE9Q4S1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pde8bE9Q4S1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pde8bE9Q4S1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pde8bE9Q4S1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pde8bE9Q4S1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde8bE9Q4S1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde8bE9Q4S1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde8bE9Q4S1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde8bE9Q4S1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde8bE9Q4S1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde8bE9Q4S1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde8bE9Q4S1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde8bE9Q4S1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde8bE9Q4S1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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