Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4N7

Arid1b, AT-rich interactive domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid1bE9Q4N7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Arid1bE9Q4N7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arid1bE9Q4N7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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