Protein–RNA interactions for Protein: E9Q411

Nbas, Neuroblastoma-amplified sequence, mousemouse

Predictions only

Length 2,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbasE9Q411 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NbasE9Q411 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NbasE9Q411 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms