Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
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