Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms