Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610021A01RikE9Q0Q3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms