Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0N7

4930426L09Rik, RIKEN cDNA 4930426L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930426L09RikE9Q0N7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930426L09RikE9Q0N7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
4930426L09RikE9Q0N7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930426L09RikE9Q0N7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930426L09RikE9Q0N7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930426L09RikE9Q0N7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
4930426L09RikE9Q0N7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930426L09RikE9Q0N7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930426L09RikE9Q0N7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930426L09RikE9Q0N7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930426L09RikE9Q0N7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930426L09RikE9Q0N7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930426L09RikE9Q0N7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930426L09RikE9Q0N7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
4930426L09RikE9Q0N7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930426L09RikE9Q0N7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
4930426L09RikE9Q0N7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930426L09RikE9Q0N7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930426L09RikE9Q0N7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930426L09RikE9Q0N7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
4930426L09RikE9Q0N7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930426L09RikE9Q0N7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930426L09RikE9Q0N7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms