Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rsph10bE9PYQ0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rsph10bE9PYQ0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms