Protein–RNA interactions for Protein: E9PW74

Gimd1, GTPase IMAP family member GIMD1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimd1E9PW74 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gimd1E9PW74 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gimd1E9PW74 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gimd1E9PW74 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gimd1E9PW74 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gimd1E9PW74 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gimd1E9PW74 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gimd1E9PW74 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gimd1E9PW74 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gimd1E9PW74 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gimd1E9PW74 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gimd1E9PW74 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gimd1E9PW74 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gimd1E9PW74 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gimd1E9PW74 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gimd1E9PW74 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gimd1E9PW74 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gimd1E9PW74 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gimd1E9PW74 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gimd1E9PW74 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gimd1E9PW74 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gimd1E9PW74 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gimd1E9PW74 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gimd1E9PW74 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gimd1E9PW74 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gimd1E9PW74 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gimd1E9PW74 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gimd1E9PW74 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gimd1E9PW74 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gimd1E9PW74 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gimd1E9PW74 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gimd1E9PW74 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gimd1E9PW74 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gimd1E9PW74 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gimd1E9PW74 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gimd1E9PW74 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gimd1E9PW74 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms