Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms