Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clca3bE9PUL3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clca3bE9PUL3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms