Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
5430403G16RikD3Z5L4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 328.1 ms