Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R4

Nkx6-2, NK6 homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-2D3Z4R4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx6-2D3Z4R4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms