Protein–RNA interactions for Protein: D3Z460

Gm1330, Predicted gene 1330, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1330D3Z460 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm1330D3Z460 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm1330D3Z460 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms