Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samd1D3YXK1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.7 ms