Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4950D3YUM8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4950D3YUM8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4950D3YUM8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4950D3YUM8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4950D3YUM8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4950D3YUM8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4950D3YUM8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4950D3YUM8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4950D3YUM8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4950D3YUM8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4950D3YUM8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4950D3YUM8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4950D3YUM8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm4950D3YUM8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm4950D3YUM8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4950D3YUM8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms