Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd8B9EJ80 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms