Protein–RNA interactions for Protein: B9EHI3

1700006A11Rik, 1700006A11Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700006A11RikB9EHI3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700006A11RikB9EHI3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700006A11RikB9EHI3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms