Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf11bB4XVQ1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms