Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf11cB4XVP9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms