Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfia1B2RXQ2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms