Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms