Protein–RNA interactions for Protein: B2RRL2

Jrkl, Jerky protein homolog-like, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrklB2RRL2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
JrklB2RRL2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
JrklB2RRL2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
JrklB2RRL2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
JrklB2RRL2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
JrklB2RRL2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
JrklB2RRL2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
JrklB2RRL2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
JrklB2RRL2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
JrklB2RRL2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
JrklB2RRL2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
JrklB2RRL2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms