Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms