Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CK137956B1AYM9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CK137956B1AYM9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CK137956B1AYM9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CK137956B1AYM9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CK137956B1AYM9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CK137956B1AYM9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CK137956B1AYM9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CK137956B1AYM9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CK137956B1AYM9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CK137956B1AYM9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CK137956B1AYM9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CK137956B1AYM9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CK137956B1AYM9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CK137956B1AYM9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CK137956B1AYM9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CK137956B1AYM9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CK137956B1AYM9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CK137956B1AYM9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CK137956B1AYM9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CK137956B1AYM9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CK137956B1AYM9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CK137956B1AYM9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CK137956B1AYM9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CK137956B1AYM9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CK137956B1AYM9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CK137956B1AYM9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CK137956B1AYM9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CK137956B1AYM9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CK137956B1AYM9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CK137956B1AYM9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CK137956B1AYM9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CK137956B1AYM9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms