Protein–RNA interactions for Protein: B1AVP0

Phactr2, Phosphatase and actin regulator, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr2B1AVP0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Phactr2B1AVP0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phactr2B1AVP0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms