Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trabd2bB1ATG9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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