Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 202.1 ms