Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms