Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9E4

Ttll2, Probable tubulin polyglutamylase TTLL2, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll2A4Q9E4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttll2A4Q9E4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttll2A4Q9E4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttll2A4Q9E4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttll2A4Q9E4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttll2A4Q9E4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttll2A4Q9E4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttll2A4Q9E4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttll2A4Q9E4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttll2A4Q9E4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttll2A4Q9E4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttll2A4Q9E4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttll2A4Q9E4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttll2A4Q9E4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttll2A4Q9E4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttll2A4Q9E4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttll2A4Q9E4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttll2A4Q9E4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttll2A4Q9E4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttll2A4Q9E4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttll2A4Q9E4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttll2A4Q9E4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttll2A4Q9E4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttll2A4Q9E4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttll2A4Q9E4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttll2A4Q9E4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttll2A4Q9E4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttll2A4Q9E4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttll2A4Q9E4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttll2A4Q9E4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttll2A4Q9E4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttll2A4Q9E4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll2A4Q9E4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms