Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Palm3A2TJV2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Palm3A2TJV2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms