Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Htra4A2RT60 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Htra4A2RT60 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htra4A2RT60 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htra4A2RT60 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htra4A2RT60 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htra4A2RT60 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htra4A2RT60 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htra4A2RT60 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htra4A2RT60 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htra4A2RT60 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htra4A2RT60 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htra4A2RT60 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Htra4A2RT60 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htra4A2RT60 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htra4A2RT60 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htra4A2RT60 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htra4A2RT60 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htra4A2RT60 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htra4A2RT60 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htra4A2RT60 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htra4A2RT60 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htra4A2RT60 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htra4A2RT60 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htra4A2RT60 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htra4A2RT60 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htra4A2RT60 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htra4A2RT60 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htra4A2RT60 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htra4A2RT60 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htra4A2RT60 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htra4A2RT60 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htra4A2RT60 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htra4A2RT60 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htra4A2RT60 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htra4A2RT60 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htra4A2RT60 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htra4A2RT60 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htra4A2RT60 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htra4A2RT60 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htra4A2RT60 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms