Protein–RNA interactions for Protein: A2J008

Trgv2, MCG146472 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trgv2A2J008 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trgv2A2J008 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trgv2A2J008 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trgv2A2J008 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trgv2A2J008 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trgv2A2J008 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trgv2A2J008 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trgv2A2J008 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trgv2A2J008 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trgv2A2J008 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trgv2A2J008 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trgv2A2J008 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trgv2A2J008 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trgv2A2J008 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trgv2A2J008 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trgv2A2J008 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trgv2A2J008 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trgv2A2J008 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trgv2A2J008 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trgv2A2J008 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trgv2A2J008 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trgv2A2J008 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trgv2A2J008 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trgv2A2J008 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trgv2A2J008 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trgv2A2J008 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trgv2A2J008 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trgv2A2J008 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms